Suy nghĩ trực quan cổ điển về nguyên nhân - kết quả được phát triển trong thời Phục hưng và đạt đến đỉnh cao trong cơ học Newton. Khái niệm "một bệnh - một cách chữa" vẫn thống trị trong y học ngày nay chính là một phản ánh của cách tư duy này. Trong mô hình khoa học cổ điển (và cả trong y học cổ truyền), người ta cho rằng có sự tách biệt giữa người quan sát và hiện tượng được quan sát. Trong mô hình này, người ta tin rằng các vật thể riêng lẻ tác động qua lại với nhau mà không bị ảnh hưởng bởi hành vi quan sát. Tiền đề cơ bản của quan điểm này là một vật thể có thể gây ra tác động lên một vật thể khác, hoàn toàn độc lập với người quan sát.

Trong lý thuyết lượng tử hiện đại, người ta đã xác định rằng không tồn tại những người quan sát độc lập (những người không ảnh hưởng đến thứ được quan sát). Bản chất của thứ được quan sát và hành động quan sát nó đều có ảnh hưởng đến những gì được tìm thấy. Trong vật lý, tính hợp lệ của nguyên tắc này đã được chứng minh rõ ràng bởi tính chất sóng-hạt đối ngẫu của electron. Người ta không biết liệu electron là sóng hay hạt. Trong một thí nghiệm để phát hiện sóng, electron hoạt động như sóng. Trong một thí nghiệm khác để phát hiện hạt, electron hoạt động như hạt. Vậy chúng thực sự là gì? Các thí nghiệm này đã chứng minh rằng electron dường như là thứ mà người thí nghiệm đang tìm kiếm và đo lường! Hành động quan sát, hơn bất kỳ thực tế nào có sẵn, quyết định cách chúng xuất hiện. Một diễn đạt triết học cho ý tưởng này được phản ánh trong câu nói phổ biến: "Nếu bạn đang tìm kiếm rắc rối, bạn có thể sẽ tìm thấy nó."

Trong một thí nghiệm khác, các nhà nghiên cứu được đưa cho hai nhóm chuột. Họ được thông báo rằng một nhóm được lai tạo để thông minh hơn và nhóm còn lại thì khá ngu ngốc. Các nhà nghiên cứu được yêu cầu kiểm tra từng nhóm chuột để xem nhóm chuột thông minh học chạy qua mê cung nhanh hơn bao nhiêu. Đúng như dự đoán, nhóm chuột thông minh thực sự học được cách chạy qua mê cung nhanh hơn đáng kể. Sau đó là điều bất ngờ: Tất cả chuột từ cả hai nhóm đều có nguồn gốc di truyền giống nhau. Sự khác biệt duy nhất là kỳ vọng của các nhà nghiên cứu.

Trong một thí nghiệm tương tự, các giáo viên được thông báo rằng một số học sinh đặc biệt thông minh. Mặc dù học sinh chỉ có trí thông minh trung bình, nhưng chúng đã xuất sắc trong các khóa học khi giáo viên mong đợi chúng xuất sắc. Những kết quả đáng ngạc nhiên này, hoàn toàn phù hợp với lý thuyết lượng tử, đặt ra nghi ngờ về tính chính xác của nhiều nghiên cứu khoa học được thực hiện trong suốt lịch sử. Những ví dụ này ngầm cho thấy rằng trong vũ trụ của chúng ta, có xu hướng tìm thấy những gì bạn đang tìm kiếm!

Một điều kiện cơ bản khác của lý thuyết lượng tử là " nguyên lý chồng chất," nó cho rằng mọi thứ đều liên quan và kết nối với mọi thứ khác. Trong một vũ trụ như vậy, việc đưa ra bất kỳ tuyên bố chắc chắn nào về nguyên nhân và kết quả đều là không thể. Để hiểu được các hiện tượng quan sát, cần phải cô lập và trừu tượng chúng ra khỏi thế giới lượng tử bao quát vào thế giới cổ điển đặc biệt của thời gian và không gian. Sau đó, hệ thống nghiên cứu có tính cá nhân, có thể đo lường và có thể đưa ra tuyên bố về bản chất của nó. Tuy nhiên, bất kỳ việc đo lường và tuyên bố nào về "hiện thực" của hệ thống nghiên cứu đều phụ thuộc vào điểm tham chiếu, ngữ cảnh của các cuộc điều tra và kỳ vọng của các nhà nghiên cứu chính mình. 

Mặc dù lý thuyết lượng tử đã được chấp nhận bởi hầu hết các ngành khoa học, nhưng nhiều người trong lĩnh vực y học vẫn giữ vững tư duy nguyên nhân và kết quả được định nghĩa bởi cơ học Newton. Y học hiện đại “cổ điển” vẫn dựa trên các kỹ thuật chẩn đoán và điều trị của mình theo khái niệm ổ khóa và chìa khóa, trong đó ổ khóa là bệnh và chìa khóa là thuốc hoặc kỹ thuật y tế (thuốc hóa học, phẫu thuật, v.v.). Mô hình tư duy này ngầm định rằng mỗi bộ phận của cơ thể và thực sự là mỗi tế bào đều là một thực thể độc lập có thể được điều trị cho các rối loạn độc lập của nó. 

Tuy nhiên, ở một cơ thể đa bào như cơ thể người, các tế bào không tồn tại độc lập với nhau. Trong lịch sử, khái niệm về tế bào riêng lẻ và bệnh lý của nó (Virchow, 1858) đã dẫn đến tư duy "một bệnh, một phương pháp chữa trị cụ thể". Trong tư duy này, các hiện tượng cá nhân trải qua khi bị bệnh sẽ bị bỏ qua để ưu tiên các mô hình bệnh tật được xác định cụ thể. Các triệu chứng được định lượng và sử dụng làm chỉ số của các hội chứng cụ thể. Nếu giá trị của một xét nghiệm nào đó vượt quá mức quy định, bạn mắc hội chứng đó. Sau khi điều trị hiệu quả, các giá trị lại phải giảm xuống dưới mức quy định. Điều trị hiệu quả trong quan điểm này có nghĩa là "làm bình thường hóa" các giá trị - đưa chúng trở lại phạm vi được chấp nhận. Tệ hại nhất là giáo điều khoa học này dẫn đến việc điều trị theo mô hình bệnh tật thay vì điều trị cho bệnh nhân.

Ví dụ, một bệnh nhân ung thư vú đã di căn sang nhiều vùng khác trên cơ thể. Vào tháng 5, sau khi phẫu thuật ngực và hóa trị, cô được thông báo chuẩn bị cho cái chết trước tháng 9. Số lượng tế bào lympho T của cô ấy là 18/μL. Mức bình thường được định nghĩa là trong khoảng từ 1000 đến 3500/μL. Bệnh nhân này có sở thích chạy bộ và vẫn tiếp tục chạy 17 km mỗi ngày. Đến tháng 2, cô vẫn còn sống và số lượng tế bào T của cô đã tăng lên 76/μL. Các bác sĩ nói rằng sự gia tăng này quá nhỏ để có bất kỳ ý nghĩa nào. Thậm chí ý tưởng tập thể dục thường xuyên có thể giúp cô ấy kéo dài sự sống và cải thiện sức khỏe cũng không được cân nhắc. Cô được thông báo rằng sự gia tăng số lượng tế bào T không có ý nghĩa gì và không nên để nó nhen nhóm hy vọng viển vông, vì cô sẽ sớm qua đời.

Quan điểm y học kiểu này tự động đặt ra giới hạn đối với các nỗ lực điều trị tiềm năng có thể được cân nhắc. Bằng cách chỉ xem xét các giá trị xét nghiệm, bác sĩ có thể chẩn đoán và kê đơn nhanh chóng, do đó khám được nhiều bệnh nhân hơn mỗi ngày. Vấn đề là trong mô hình đơn giản này, không có chỗ cho sự khác biệt cá nhân. Không có chỗ cho suy nghĩ rằng cùng một triệu chứng có thể do các nguyên nhân khác nhau gây ra. Cũng không có chỗ cho thực tế rằng cùng một loại thuốc có thể tạo ra các tác dụng khác nhau ở hai bệnh nhân riêng biệt, mặc dù họ có cùng các triệu chứng biểu hiện. Người ta quan tâm nhiều hơn đến kết quả của các xét nghiệm y tế hơn là cảm giác của bệnh nhân hoặc nguyên nhân của các triệu chứng được nhìn nhận trong bối cảnh sinh học/cơ địa cá nhân của họ, hoặc được xem xét liên quan đến chất lượng lối sống của họ.

Trong các bệnh cấp tính, nơi tổn thương mô hoặc nhiễm trùng do vi sinh vật là nguyên nhân chính, phương pháp chẩn đoán và điều trị y học hiện đại “cổ điển” cực kỳ hiệu quả. Ở hầu hết các bệnh cấp tính, một nguyên nhân cụ thể lại có vai trò quan trọng hơn những nguyên nhân khác. Trong những trường hợp như vậy, quan niệm "một bệnh - một phương pháp điều trị" thường thành công. Các bác sĩ sử dụng phương pháp này đã phát triển các phương pháp điều trị hiệu quả cho hầu hết các vấn đề y tế cấp tính. Nhờ những thành công to lớn này, thế giới phần lớn đã thoát khỏi nhiều bệnh tật thường gây tử vong trong quá khứ. Ngày nay, tình hình đã thay đổi. Các vấn đề y tế phổ biến nhất không còn là "bệnh cấp tính" nữa, mà thay vào đó là các khối u và các bệnh thoái hóa mãn tính khác. Và tư duy y học hiện đại “ cổ điển” đang bế tắc trong việc giải quyết những vấn đề này.

Vì ngày nay mọi người hiếm khi chết trẻ vì thương tích, nhiễm trùng và các bệnh truyền nhiễm, tuổi thọ trung bình đã tăng lên đáng kể. Chức năng cơ thể và khả năng phục hồi, tái tạo giảm dần theo tuổi tác. Người già thường chết vì các bệnh thoái hóa. Số lượng người cao tuổi tăng là một lý do khiến các bệnh thoái hóa phổ biến hơn ngày nay. Nhưng thực tế là ngày nay có nhiều người trẻ mắc các bệnh thoái hóa hơn so với những năm trước đây cho thấy ngoài tuổi tác còn có những nguyên nhân khác.

Theo mô hình ổ khóa và chìa khóa, bác sĩ sẽ kê thuốc hóa dược để tiêu diệt vi khuẩn, hoặc trong trường hợp nhiễm virus, sẽ kê một loại hóa chất ức chế sự sinh sản của virus. Nhưng nghiên cứu y học đã tiết lộ rằng nhiều vi khuẩn và vi rút gây bệnh sống trên và trong cơ thể chúng ta liên tục. Thường thì, câu hỏi tại sao cơ thể lại dễ bị nhiễm trùng vào thời điểm cụ thể này lại không được đặt ra. Để nhận thức được sự tồn tại của một câu hỏi như vậy, bác sĩ cần mở rộng cách suy nghĩ từ mô hình cơ học Newton cổ điển thường thống trị lĩnh vực y học sang các khái niệm đa chiều, mở rộng hơn của lý thuyết lượng tử và lý thuyết hỗn loạn hiện đại.

Bất kỳ ai trồng vườn đều quan sát thấy côn trùng thích tấn công những cây đã yếu. Tương tự như vậy, bất kỳ ai từng quan sát tình trạng sức khỏe thay đổi của chính mình đều biết rằng họ dễ bị nhiễm các loại virus cảm lạnh luôn tồn tại xung quanh hơn khi họ kiệt sức, lạnh, đói, buồn bực hoặc căng thẳng quá mức. Khi cơ thể bị căng thẳng, vi khuẩn thường trú trên da có thể dễ dàng gây nhiễm trùng vết cắt.

Nhìn nhận theo hướng này, việc dùng thuốc để chống lại tác nhân gây nhiễm, mặc dù tạm thời hiệu quả đối với bệnh cấp tính, nhưng có thể đang bỏ qua nhiều nguyên nhân khác khiến người đó bị bệnh ngay từ đầu. Và bằng chứng cho thấy rằng, nếu không được điều chỉnh, những căng thẳng đa dạng này có thể gây ra tái phát hoặc thậm chí cuối cùng dẫn đến bệnh thoái hóa.

Hơn nữa, người ta cũng biết rằng những người dễ bị nhiễm trùng và ốm vài lần mỗi năm lại có tỷ lệ mắc các bệnh ung thư phổ biến nhất thấp hơn chúng ta. Tuy nhiên, lợi ích này sẽ bị mất đi nếu họ dùng thuốc ngăn hệ thống miễn dịch xây dựng sức mạnh bằng cách thực hiện cuộc chiến tự nhiên chống lại các tác nhân gây nhiễm. Nghiên cứu cho thấy rõ ràng rằng hệ thống miễn dịch cần phải chiến đấu với bệnh tật theo thời gian để duy trì trạng thái khỏe mạnh. Khi các bệnh truyền nhiễm trở nên nghiêm trọng, thuốc có thể cứu sống người bệnh. Nhưng việc sử dụng chúng cho mọi bệnh truyền nhiễm nhỏ có thể thực sự là một trong những nguyên nhân gây ra các bệnh nghiêm trọng như ung thư!

Cơ học Newton định nghĩa các hệ thống vật lý hoạt động theo cách tuyến tính. Một ví dụ về hệ thống tuyến tính là một con lắc đơn. Dao động của nó không phụ thuộc vào ảnh hưởng của bất kỳ vật thể riêng biệt nào trong môi trường xung quanh và tương đối độc lập với tác động của người quan sát. Điều này tương tự như mô hình y học của tế bào đơn lẻ, biệt lập được thảo luận ở trên.

Tuy nhiên, các khái niệm về trí tuệ nhân tạo (cybernetics) (Wiener, 1963), lý thuyết hỗn loạn và hệ thống năng lượng mở về nhiệt động học (Prigogine, 1979) đã chỉ ra rằng các hệ thống sinh học là phi tuyến tính. Một ví dụ đơn giản về hệ thống phi tuyến tính là nhiều quả lắc khác nhau được kết nối với nhau thông qua các lò xo. Khi một quả lắc được di chuyển, năng lượng ban đầu chuyển sang quả lắc gần và sau đó là các quả lắc xa hơn, rồi quay lại cho đến khi tất cả đều đồng bộ trong sự cộng hưởng hài hòa. Giống như những quả lắc kết nối này, hầu hết các cấu trúc trong các hệ thống phi tuyến tính đều tự lặp đi lặp lại. Cùng một mô hình cấu trúc và chuyển động được thấy ở nhiều cấp độ khác nhau. Nguyên tắc này được quan sát khắp nơi trong tự nhiên.

Trong thế kỷ XVIII, Ernst Chaldni đặt cát lên một tấm kính mỏng và làm cho tấm kính rung động bằng cách kéo vĩ cầm lên mép. Cát rung lên tạo thành các hình học đẹp mắt lặp lại trên bề mặt (gọi là các hình Chaldnian). Chaldni đã công bố những phát hiện của mình trong cuốn sách "Entdeckungen über die Theorie des Klanges" (Leipzig, 1787). Nhà khoa học Thụy Sĩ, Hans Jenny, dành mười năm nghiên cứu sức mạnh của âm thanh trong việc tạo ra các mô hình hình học trong các chất vô cơ khác nhau. Các mô hình do rung động âm thanh tạo ra trong các thí nghiệm của ông giống như sao biển, vi khuẩn, cơ quan và các mô hình khác được thấy trong các hình thức của sự sống. Trong "Cymatics" (1974), ông kết luận rằng khi nói đến sự tổ chức, các hình hài hòa của vật lý về cơ bản giống như các mô hình hài hòa của thiên nhiên hữu cơ. 

Các mô hình vật lý này được nhìn thấy trong tất cả các hệ thống sống. Đặc điểm chính của chúng là sự trùng lặp (redundancy), nghĩa là các mẫu giống nhau được lặp đi lặp lại nhiều lần trên nhiều cấp độ cho đến khi lấp đầy không gian có sẵn. Ví dụ, trong hệ thống tuần hoàn, mỗi động mạch lại phân nhánh thành các tiểu động mạch và mao mạch nhỏ hơn và nhỏ hơn nữa, nhưng về cơ bản chúng có hình dạng giống hệt nhau. Phổi cũng cung cấp một ví dụ tương tự. Phổi về cơ bản là một túi khí được chia thành các túi khí nhỏ hơn và nhỏ hơn nữa. Nguyên tắc dự phòng này cũng có thể được nhìn thấy trong hình dạng của hầu hết các cơ quan, được phân đoạn với mỗi phân đoạn cũng được phân đoạn và cứ thế cho đến khi mỗi phân đoạn phụ được lấp đầy hoàn toàn bằng các tế bào gần như giống hệt nhau.